История Института начинается с 1990 г. и связана с именем основателя и научного руководителя Александра Васильевича Иващенко, доктора химических наук, профессора, заслуженного изобретателя РСФСР, лауреата Государственной премии СССР и премии Совета Министров СССР.

Александр Васильевич основал первую организацию Центра научно-консалтинговое предприятие «Контакт-Сервис», в рамках которого были начаты работы в области сложного заказного органического синтеза для научных каталожных фирм Aldrich, Fluka, Acros, Merck и др. С 1995 года в химической лаборатории «Контакт-Сервиса» одними из первых в мире начали осваивать методы параллельного и комбинаторного синтеза библиотек органических соединений для высокопроизводительного скрининга на современных биомишениях с целью определения их биологической активности. С этого момента начинается стремительное развитие международного сотрудничества с ведущими биотехнологическими и фармацевтическими компаниями Европы, Америки и Японии.

Бурное развитие высокопроизводительного скрининга, как индустриальной технологии поиска новых кандидатов в лекарства, превратило эти технологии в индустриальный стандарт крупнейших фармацевтических компаний мира, и позволило проводить десятки тысяч биологических испытаний веществ в день, что в свою очередь потребовало миллионы новых веществ для испытаний. Именно в этот период времени Александр Васильевич приглашает в качестве основных партнеров своего сына Андрея Иващенко и его друга Николая Савчука, которые до этого реализовывали международные проекты в области информационных систем. С 1998 года разрабатываются и осуществляются основные концепции научного и инвестиционного развития, создается будущая управляющая компания Центра Высоких Технологий «ХимРар» и его «якорная» научно-исследовательская организация – ЗАО «Исследовательский Институт Химического Разнообразия» (ЗАО «ИИХР»).